Produrre biogas comporta vantaggi sia economici che ambientali.
Tra i vantaggi ambientali ritroviamo primo tra tutti la riduzione delle emissioni di gas climalteranti: infatti l’elemento principale di cui è costituito il biogas è il metano, che è un gas serra con un effetto circa venti volte superiore a quello della CO₂. Pertanto il recupero del biogas dalle discariche e il suo utilizzo come combustibile svolge un’efficace azione di riduzione dei gas climalteranti nel settore dei rifiuti. Il recupero del biogas prodotto in discarica è indispensabile anche per ovviare a problemi di sicurezza e per evitare che si verifichino vere e proprie esplosioni nella discarica.
Per quanto riguarda gli allevamenti intensivi di suini, bovini, avicunicoli, con gli impianti di digestione anaerobica si risolvono i problemi di inquinamenti del suolo e del sottosuolo e problemi di sviluppo di odori molesti. Inoltre separando le biomasse digerite dalla parte acquosa, si ottiene anche humus colloidale, utilizzabile come concime. Questo porta a un minor utilizzo di fertilizzanti chimici e al miglioramento delle proprietà chimiche e fisiche del suolo.
Infine, l’ottenimento del biogas e il suo utilizzo come combustibile riduce l’impiego di combustibili fossili.